石河子大学位于新疆天山北麓被联合国授予“人居环境改善好城市”的戈壁明珠——石河子市。石河子大学校医院，地处石河子市区31小区，现为石河子大学教辅处级单位，1996年，校医院由农业部部属的石河子农学院、石河子医学院、兵团师范专科学校的卫生科合并组建，占地面积9100㎡，建筑面积3287㎡，业务用房面积2795㎡。医疗卫生服务覆盖石河子市31、32、38小区约4万人口，共2500余户。
校医院是具有一级医院资质的基层医疗卫生机构，内设有内、外、儿、妇、公卫、口腔等临床服务项目，日常开展检验、放射、心电图、B超等辅助检查项目。医院下设住院部、南北校区两个门诊部、医技、药剂、预防保健、医务、计划生育等科室部门，医院编制40张床位，实际开放床位20张。配备有很多先进的医疗设备（美国贝克曼全自动生化仪、日本希森美康全自动血球分析仪、德国罗氏化学发光检测仪，德国西门子超高端彩色B超设备，柯达DR摄片机，DR配套高清相机、口腔曲面断层机、动态血压和心电图监测仪、心电监护仪、口腔综合治疗台、生物安全柜等价值近550万左右。）达到师市两大医院同类型仪器档次，使每一位师生员工都能享受到现代化先进设备的服务。
全院现有37名工作人员（其中在编21人，同工同酬14人），其中卫生技术人员33人：执业医师16人，注册护士12人，执业药师2人；管理人员2人，非卫生专业技术人员4人，专业技术人员占全院职工总数89.2%。研究生学历1人，大学本科学历26人，大专学历7人，中专学历3人；正高职称1人，副高职称2人，中级职称17人，初级职称16人，高级技师1人。
多年来，校医院紧紧围绕学校人才培养的核心工作，坚持解放思想、转变观念，牢固树立“心系师生、竭诚服务”的宗旨，充分发挥医疗、预防、保健、健康教育等职能，建立完善师生健康保障体系，倾情打造师生健康教育平台，为学校教育教学改革和发展，全力做好医疗保障服务工作。